天仙藤全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析
摘要: 目的:獲得天仙藤全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),挖掘天仙藤功能基因。方法:采用PacBio SequeⅠ高通量測(cè)序系統(tǒng),對(duì)天仙藤的莖、葉、果3個(gè)部位的混合樣品進(jìn)行全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析。結(jié)果:共獲得176 354條環(huán)形一致性序列(CCS),獲得184 439個(gè)高質(zhì)量isoforms,并注釋了139 826個(gè)isoforms,檢測(cè)出3058個(gè)轉(zhuǎn)錄因子和135 527個(gè)簡(jiǎn)單序列重復(fù)(SSR)位點(diǎn),... ...
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