藥用植物青葙全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析
摘要: 目的:構(gòu)建藥用植物青葙全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組,旨在為青葙功能基因組學(xué)研究提供遺傳信息。方法:基于PacBio Sequel平臺(tái)對(duì)青葙的根、莖、葉、花、果5個(gè)部位的混合樣本進(jìn)行高通量測(cè)序,對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行校正、篩選、聚類、去冗余、過(guò)濾、功能注釋和結(jié)構(gòu)分析,獲得青葙全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。結(jié)果:經(jīng)質(zhì)量控制后獲得高質(zhì)量測(cè)序reads數(shù)據(jù)量為13.46 Gb,拼接去冗余后獲得155 300條循環(huán)一致性序列(... ...
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