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基于DNABERT編碼的啟動(dòng)子預(yù)測模型

摘要： 啟動(dòng)子是位于基因上游區(qū)域的特定DNA序列，通過識(shí)別和預(yù)測DNA序列中的啟動(dòng)子，可以更好地理解基因調(diào)控的機(jī)制，促進(jìn)生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的進(jìn)展。通過實(shí)驗(yàn)的方法來預(yù)測啟動(dòng)子既昂貴又費(fèi)時(shí)，而通過計(jì)算方法進(jìn)行啟動(dòng)子預(yù)測同樣存在不足之處，如精度有待提升、序列編碼方式所包含的信息量不足等。該文提出了一種新的編碼方式，將預(yù)訓(xùn)練模型DNABERT應(yīng)用于啟動(dòng)子預(yù)測的編碼，并測試了使用不同深度學(xué)習(xí)模型進(jìn)... ... （共7頁）

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