兔源腸致病性大腸埃希菌全基因組測序及毒力和耐藥基因分析
摘要: 目的 揭示一株從腹瀉實(shí)驗兔中分離到的腸致病性大腸埃希菌ILAREc-01的基因組特征、毒力基因和耐藥基因分布情況。方法 采用高通量測序法對基因組序列進(jìn)行測定,采用VFDB、ARDB、CAZy、SWISS-PROT、COG、CARD、KEGG、T3SS等8個數(shù)據(jù)庫對基因組中的基因功能進(jìn)行預(yù)測,并且對ILAREc-01菌株進(jìn)行了遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果 ILAREc-01基因組中編碼5 ... ...
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