基于454測序的碧桃花瓣組織轉(zhuǎn)錄組核苷酸變異

摘要： 通過對碧桃花瓣組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,獲得1 556 684條序列,平均讀長446 bp,共計(jì)695.34 Mb數(shù)據(jù),其中1 492 289條高質(zhì)量序列經(jīng)拼接后得到22 762個(gè)重疊群。以拼接后的重疊群作為參考序列,利用SNP/In Del分析軟件檢測碧桃花瓣組織轉(zhuǎn)錄組中的核苷酸變異位點(diǎn),共得到9 836個(gè)SNP和1 550個(gè)In Del位點(diǎn)。在SNP位點(diǎn)中,轉(zhuǎn)換占62.55%、顛換占37.45%,A/G的變異最為豐富,C/G的變異最少。在In Del位點(diǎn)中,有34.71%的位點(diǎn)為單核苷酸插入、缺失突變。 （共4頁）