碧桃花瓣轉(zhuǎn)錄組微衛(wèi)星特征分析

摘要： 為開發(fā)碧桃轉(zhuǎn)錄組微衛(wèi)星信息,利用454高通量測序技術,對其花瓣轉(zhuǎn)錄組序列進行SSR位點發(fā)掘,結(jié)果發(fā)現(xiàn)含SSR的序列4 705條,共得到5 668個SSR,平均每3.49 kb出現(xiàn)1個SSR。微衛(wèi)星序列主要以三堿基重復為主,約占總數(shù)的42.66%。筆者共發(fā)現(xiàn)516種堿基重復基元,所占比例最高的為(AG/CT)n(18.34%),其次是(AAG/CTT)n(12.42%)。微衛(wèi)星多為重復長度小于20 bp的短序列,長度大于20 bp的微衛(wèi)星僅占總數(shù)的12.13%。研究還發(fā)現(xiàn)碧桃花瓣微衛(wèi)星的頻率和長度呈顯著負相關(P<0.05),相關系數(shù)為-0.246。 （共5頁）