果蠅基因組中回文序列的分布
摘要: 回文序列(palindrome)是與基因表達調(diào)控、DNA復(fù)制和重組密切相關(guān)的重要DNA模體。例如,回文序列常存在于基因表達順式作用元件中,參與基因表達調(diào)控;回文序列也可作為限制性內(nèi)切酶的識別位點或結(jié)構(gòu)信號,誘導(dǎo)重組的發(fā)生,而重組作為選擇的途徑,反過來可能會調(diào)節(jié)回文序列在染色體上的分布。在全基因組范圍內(nèi)研究回文序列的分布及其與染色體重組的關(guān)系,對從分子水平上理解基因表達調(diào)控機制及基因組進化有重要意義。本文對果蠅基因組回文序列在染色體上的分布進行了系統(tǒng)的分析,發(fā)現(xiàn)果蠅基因組對回文序列的使用是非隨機的,回文序列在染色體上的分布受到重組率、基因分布和GC含量等因素的影響?;匚男蛄胸S度、回文密度與重組率的關(guān)系,以及回文序列GC含量與重組率的關(guān)系在常染色體和X染色體上的巨大反差,預(yù)示著常染色體和X染色體在功能及進化上的某些根本性差異可能與回文序列有關(guān)。 (共10頁)
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