杭州西溪濕地沉積物細菌的群落結(jié)構(gòu)和多樣性

摘要： 采用Illumina Mi Seq高通量測序技術(shù),對杭州西溪濕地4種不同植被下沉積物的細菌多樣性進行了研究。通過提取樣品基因組DNA,對16S r RNA V3、V4區(qū)測序,共獲得有效序列67734條,產(chǎn)生2181個OTU,序列平均長度為441 bp,其中大于400bp的序列占99.74%。對97%相似水平的OTU代表序列進行分類學(xué)分析,結(jié)果表明,沉積物具有很高的細菌多樣性,涵蓋了30個門252個屬的細菌。其中變形菌門(Proteobacteria)是各樣品的優(yōu)勢類群,所占比例高達30.0%—64.7%。同時,β-變形菌綱、γ-變形菌綱和δ-變形菌綱在變形菌門中占主導(dǎo)地位,在這些類群中發(fā)現(xiàn)有大量與N、S等元素代謝相關(guān)的菌群,應(yīng)該在濕地沉積物的元素循環(huán)中發(fā)揮著重要作用。此外,4個樣品中約有10%—15%的序列屬于無法確定分類位置(Unclassified)的類群,說明西溪濕地沉積物中蘊藏有較多的潛在新物種。本研究結(jié)果將為西溪濕地的保護和修復(fù)提供理論和實踐依據(jù)。 （共8頁）