mRNA序列中回文密度對(duì)蛋白質(zhì)折疊速率的影響

摘要： 建立了一個(gè)包括回文結(jié)構(gòu)特征等核苷酸信息的蛋白質(zhì)折疊數(shù)據(jù)庫(kù),以數(shù)據(jù)庫(kù)中每一個(gè)蛋白質(zhì)為研究樣本,計(jì)算了相應(yīng)mRNA序列中回文結(jié)構(gòu)的回文密度,分析了回文密度與蛋白質(zhì)折疊速率之間的相關(guān)性.結(jié)果證實(shí),對(duì)于所有蛋白質(zhì),回文密度與蛋白質(zhì)折疊速率呈負(fù)相關(guān);進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),對(duì)蛋白質(zhì)折疊進(jìn)程真正起阻礙作用的是那些被幾個(gè)回文結(jié)構(gòu)重復(fù)使用的堿基,而且對(duì)于不同二級(jí)結(jié)構(gòu)類蛋白質(zhì)以及不同折疊類蛋白質(zhì),回文密度與蛋白質(zhì)折疊速率的相關(guān)性有很大的差異. （共5頁(yè)）