基于Transformer和門(mén)控循環(huán)單元的肽序列理論串聯(lián)質(zhì)譜圖預(yù)測(cè)方法
摘要: 針對(duì)現(xiàn)有理論串聯(lián)質(zhì)譜圖預(yù)測(cè)僅限于預(yù)測(cè)b、y主干碎片離子以及單一模型難以捕捉肽序列復(fù)雜關(guān)系的問(wèn)題,提出一種基于Transformer和門(mén)控循環(huán)單元(GRU)的肽序列理論串聯(lián)質(zhì)譜圖預(yù)測(cè)方法,名為DeepCollider。首先,通過(guò)自注意力機(jī)制和長(zhǎng)距離依賴關(guān)系,使用Transformer和GRU結(jié)合的深度學(xué)習(xí)架構(gòu)增強(qiáng)對(duì)肽序列與碎片離子強(qiáng)度關(guān)系的建模能力;其次,與現(xiàn)有方法編碼肽序列預(yù)測(cè)... (共7頁(yè))
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