摘要： 拉伸分子動(dòng)力學(xué)(SMD)模擬是揭示生物大分子在機(jī)械力作用下行為的一種重要計(jì)算方法,與蛋白質(zhì)展開的單分子力譜實(shí)驗(yàn)技術(shù)相似.盡管SMD模擬已經(jīng)廣泛應(yīng)用,但由于模擬大分子系統(tǒng)的計(jì)算需求,研究范圍受到限制.最近計(jì)算機(jī)硬件的技術(shù)進(jìn)步使得更廣泛且經(jīng)濟(jì)的模擬成為可能.本研究基于白細(xì)胞介素-6(IL-6)的解折疊過程,尋找使用GROMACS進(jìn)行SMD模擬的最佳硬件配置.研究表明,目前八核中央處... （共9頁）